Во время Великой Отечественной войны Бурденко — главный хирург Красной армии (1941—1946).
Несмотря на свои 65 лет, он сразу же выехал в действующую армию, в дальнейшем пользовался всякой возможностью, чтобы побывать на фронте. Занимался организацией помощи раненым во время боёв под Ярцевом и Вязьмой.
Для проведения сложных операций Бурденко добирался до полковых и дивизионных медсанбатов, лично провёл несколько тысяч операций.
В 1941 году академик Бурденко был второй раз контужен во время бомбардировки на переправе через Неву.
В конце сентября 1941 года под Москвой, при осмотре прибывшего с фронта военно-санитарного поезда у Николая Бурденко произошёл инсульт. Он пролежал около двух месяцев в больнице, почти полностью лишился слуха, и был эвакуирован сначала в Куйбышев, затем в Омск.
Ещё не оправившись от болезни, Бурденко в местных госпиталях занимался лечением поступивших с фронта раненых, обширной перепиской с фронтовыми хирургами передовых этапов.
Скончался 11 ноября 1946 года. Урна с прахом захоронена на Новодевичьем кладбище Москвы.
*Информация из открытых источников сети интернет