Яков Андреевич родился в 1875 году в г.Спасск Казанской губернии. В 1893 году переехал из г.Спасск в г.Санкт-Петербург. В период 1894–1904 года был тесно связан с И.Е.Репиным, занимался под его руководством в Тенишевской художественной студии (1893–98г.г.), сблизился с семьёй художника, в 1898 года вместе с ним принимал участие в похоронах И.И.Шишкина. В 1898–1904 года учился в Императорской Академии художеств. Участвовал совместно с И.Е.Репиным и его учениками в коллективном написании картины-портрета «Установка модели в академической мастерской» (1903г., хранится в музее Академии художеств), до 1917 года часто бывал в его усадьбах в Пенатах и в Финляндии, оставил о нём письменные воспоминания. Звание художника получил за картину «Повстречались» (1904г.). Исторический живописец и монументалист, педагог. Открыл в г.Санкт-Петербург художественную студию, давал практические занятия по рисунку, композиции, живописи, ввёл изучение теории, организовывал экскурсии в музеи и на выставки, где знакомил учеников с подлинниками классической живописи. Участник объединений художников им. И.Е.Репина и им. А.И.Куинджи, один из активных членов «Союза русских художников», представитель русской живописной традиции. Член Ленинградского союза советских художников.
Умер 1 января 1942 года от голода в блокадном Ленинграде.