Родился 14 октября 1920 г. в пос. Лаишево Лаишевского района ТАССР в семье сельских учителей. В 1938 г. окончив Лаишевскую среднюю школу, поступил на 1 курс биолого-почвенного факультета КГУ, в 1941 г. учебу пришлось прервать. Участник Великой Отечественной войны.
В 1941 г. был призван в армию, сначала обучался в Москве на курсах по подготовке к военным действиям, затем был переправлен в Среднюю Азию в Самарканд. В 1942 г. направлен на фронт в химические войска техником по боеприпасам.
Защищал Сталинград, с 03.1942 г.по 01.1943 г. был начальником химической службы. Воевал за Харьков, участвовал в освобождении Крыма, служил в составе 8-й воздушной армии. Из рядов вооруженных сил Гойтанников был демобилизован в 1947 г. Восстановилен как студент биолого-почвенного факультета КГУ и рекомендован в аспирантуру к профессору Маркову М.В. В 1952 году - ассистент кафедры геоботаники КГУ. В 1953 г. защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата биологических наук по теме «О взаимоотношениях между покровными растениями и травами».
В 1953 г. - инструктор отдела науки и вузов Татарского обкома КПСС. С 1954 года - директор Бугульминского учительского института, с 1955 года - заместитель заведующего отделом науки и культуры Татарского обкома КПСС.
22 ноября 1956 года приказом Министерства сельского хозяйства СССР Гойтанников С.В. назначен ректором (директором) КСХИ, проработал в этой должности по декабрь 1964 г. В 1965-1989 гг. работал в должности доцента кафедры агрохимии и почвоведения КСХИ. Трудовая, научная и педагогическая деятельность Гойтанникова С.В. была отмечена высокими государственными наградами.
Награжден орденом Отечественной войны II-й степени (1985г.), орденом «Знак Почета», медалью «За оборону Сталинграда», медалью «За Победу над Германией в Великой Отечественной войне», «Ветеран труда»; Почетная грамота Президиума Верховного Совета ТАССР
